Protein–RNA interactions for Protein: Q9H300

PARL, Presenilins-associated rhomboid-like protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARLQ9H300 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PARLQ9H300 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PARLQ9H300 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PARLQ9H300 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PARLQ9H300 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PARLQ9H300 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PARLQ9H300 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PARLQ9H300 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PARLQ9H300 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PARLQ9H300 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PARLQ9H300 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PARLQ9H300 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PARLQ9H300 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PARLQ9H300 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PARLQ9H300 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PARLQ9H300 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PARLQ9H300 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PARLQ9H300 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PARLQ9H300 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PARLQ9H300 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PARLQ9H300 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PARLQ9H300 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PARLQ9H300 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PARLQ9H300 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PARLQ9H300 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PARLQ9H300 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PARLQ9H300 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PARLQ9H300 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PARLQ9H300 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PARLQ9H300 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PARLQ9H300 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PARLQ9H300 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PARLQ9H300 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PARLQ9H300 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PARLQ9H300 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PARLQ9H300 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PARLQ9H300 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PARLQ9H300 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PARLQ9H300 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PARLQ9H300 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PARLQ9H300 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PARLQ9H300 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
PARLQ9H300 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PARLQ9H300 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PARLQ9H300 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PARLQ9H300 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PARLQ9H300 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PARLQ9H300 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PARLQ9H300 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PARLQ9H300 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PARLQ9H300 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PARLQ9H300 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PARLQ9H300 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PARLQ9H300 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PARLQ9H300 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PARLQ9H300 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PARLQ9H300 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PARLQ9H300 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PARLQ9H300 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PARLQ9H300 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PARLQ9H300 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PARLQ9H300 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PARLQ9H300 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PARLQ9H300 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PARLQ9H300 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PARLQ9H300 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PARLQ9H300 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PARLQ9H300 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PARLQ9H300 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PARLQ9H300 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PARLQ9H300 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PARLQ9H300 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PARLQ9H300 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PARLQ9H300 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PARLQ9H300 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PARLQ9H300 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PARLQ9H300 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PARLQ9H300 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PARLQ9H300 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PARLQ9H300 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PARLQ9H300 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PARLQ9H300 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PARLQ9H300 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PARLQ9H300 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PARLQ9H300 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PARLQ9H300 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PARLQ9H300 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PARLQ9H300 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PARLQ9H300 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PARLQ9H300 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PARLQ9H300 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PARLQ9H300 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PARLQ9H300 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PARLQ9H300 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PARLQ9H300 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PARLQ9H300 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PARLQ9H300 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PARLQ9H300 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PARLQ9H300 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PARLQ9H300 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms