Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms