Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms