Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms