Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IFT27Q9BW83 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFT27Q9BW83 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFT27Q9BW83 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFT27Q9BW83 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFT27Q9BW83 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFT27Q9BW83 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFT27Q9BW83 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFT27Q9BW83 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFT27Q9BW83 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFT27Q9BW83 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFT27Q9BW83 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFT27Q9BW83 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFT27Q9BW83 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFT27Q9BW83 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFT27Q9BW83 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFT27Q9BW83 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFT27Q9BW83 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFT27Q9BW83 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFT27Q9BW83 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFT27Q9BW83 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFT27Q9BW83 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFT27Q9BW83 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFT27Q9BW83 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFT27Q9BW83 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFT27Q9BW83 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFT27Q9BW83 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFT27Q9BW83 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFT27Q9BW83 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFT27Q9BW83 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFT27Q9BW83 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFT27Q9BW83 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFT27Q9BW83 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFT27Q9BW83 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFT27Q9BW83 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFT27Q9BW83 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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