Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV29

CCDC32, Coiled-coil domain-containing protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC32Q9BV29 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms