Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RSG1Q9BU20 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms