Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms