Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms