Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF8Q9BRL6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF8Q9BRL6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms