Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CMSS1Q9BQ75 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CMSS1Q9BQ75 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CMSS1Q9BQ75 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CMSS1Q9BQ75 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CMSS1Q9BQ75 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CMSS1Q9BQ75 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CMSS1Q9BQ75 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CMSS1Q9BQ75 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CMSS1Q9BQ75 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CMSS1Q9BQ75 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CMSS1Q9BQ75 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CMSS1Q9BQ75 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CMSS1Q9BQ75 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMSS1Q9BQ75 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMSS1Q9BQ75 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMSS1Q9BQ75 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMSS1Q9BQ75 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMSS1Q9BQ75 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMSS1Q9BQ75 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMSS1Q9BQ75 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMSS1Q9BQ75 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMSS1Q9BQ75 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMSS1Q9BQ75 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMSS1Q9BQ75 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMSS1Q9BQ75 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMSS1Q9BQ75 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMSS1Q9BQ75 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMSS1Q9BQ75 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMSS1Q9BQ75 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMSS1Q9BQ75 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms