Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms