Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms