Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM227BQ96M60 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM227BQ96M60 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms