Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM47Q96LD4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms