Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG4CQ96DT6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms