Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
KCTD12Q96CX2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCTD12Q96CX2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCTD12Q96CX2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCTD12Q96CX2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCTD12Q96CX2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCTD12Q96CX2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCTD12Q96CX2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCTD12Q96CX2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCTD12Q96CX2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCTD12Q96CX2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCTD12Q96CX2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCTD12Q96CX2 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KCTD12Q96CX2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCTD12Q96CX2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCTD12Q96CX2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCTD12Q96CX2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCTD12Q96CX2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCTD12Q96CX2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCTD12Q96CX2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCTD12Q96CX2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCTD12Q96CX2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCTD12Q96CX2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCTD12Q96CX2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCTD12Q96CX2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCTD12Q96CX2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCTD12Q96CX2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCTD12Q96CX2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCTD12Q96CX2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCTD12Q96CX2 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KCTD12Q96CX2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCTD12Q96CX2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCTD12Q96CX2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KCTD12Q96CX2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCTD12Q96CX2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCTD12Q96CX2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCTD12Q96CX2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCTD12Q96CX2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCTD12Q96CX2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCTD12Q96CX2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCTD12Q96CX2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCTD12Q96CX2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCTD12Q96CX2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCTD12Q96CX2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCTD12Q96CX2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCTD12Q96CX2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCTD12Q96CX2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCTD12Q96CX2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCTD12Q96CX2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms