Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RFT1Q96AA3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFT1Q96AA3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms