Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SNX21Q969T3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms