Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOBEC4Q8WW27 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms