Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms