Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW6

N4BP2, NEDD4-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP2Q86UW6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
N4BP2Q86UW6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms