Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG4DQ86TL0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms