Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms