Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms