Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms