Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C16orf54Q6UWD8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms