Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L2Q6R6M4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L2Q6R6M4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L2Q6R6M4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L2Q6R6M4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L2Q6R6M4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L2Q6R6M4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L2Q6R6M4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L2Q6R6M4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L2Q6R6M4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L2Q6R6M4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L2Q6R6M4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L2Q6R6M4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L2Q6R6M4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L2Q6R6M4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L2Q6R6M4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L2Q6R6M4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L2Q6R6M4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L2Q6R6M4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L2Q6R6M4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L2Q6R6M4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L2Q6R6M4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L2Q6R6M4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L2Q6R6M4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L2Q6R6M4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L2Q6R6M4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L2Q6R6M4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L2Q6R6M4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L2Q6R6M4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L2Q6R6M4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L2Q6R6M4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L2Q6R6M4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L2Q6R6M4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L2Q6R6M4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L2Q6R6M4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L2Q6R6M4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L2Q6R6M4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L2Q6R6M4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms