Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
TRNP1Q6NT89 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRNP1Q6NT89 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms