Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms