Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms