Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CARMIL1Q5VZK9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CARMIL1Q5VZK9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms