Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms