Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GARNL3Q5VVW2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms