Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COLEC12Q5KU26 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms