Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms