Protein–RNA interactions for Protein: Q17RD7

SYT16, Synaptotagmin-16, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT16Q17RD7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYT16Q17RD7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms