Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RTL8BQ17RB0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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