Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLPPQ16740 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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