Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FSCN1Q16658 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FSCN1Q16658 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FSCN1Q16658 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FSCN1Q16658 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FSCN1Q16658 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FSCN1Q16658 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FSCN1Q16658 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FSCN1Q16658 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FSCN1Q16658 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FSCN1Q16658 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FSCN1Q16658 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FSCN1Q16658 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FSCN1Q16658 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FSCN1Q16658 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FSCN1Q16658 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FSCN1Q16658 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FSCN1Q16658 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FSCN1Q16658 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FSCN1Q16658 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FSCN1Q16658 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FSCN1Q16658 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FSCN1Q16658 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FSCN1Q16658 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FSCN1Q16658 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FSCN1Q16658 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FSCN1Q16658 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FSCN1Q16658 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FSCN1Q16658 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FSCN1Q16658 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FSCN1Q16658 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FSCN1Q16658 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FSCN1Q16658 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FSCN1Q16658 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FSCN1Q16658 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FSCN1Q16658 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FSCN1Q16658 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FSCN1Q16658 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FSCN1Q16658 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FSCN1Q16658 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FSCN1Q16658 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FSCN1Q16658 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FSCN1Q16658 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FSCN1Q16658 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FSCN1Q16658 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms