Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRF1Q16656 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms