Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAPC1Q16533 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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