Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS72Q15906 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS72Q15906 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
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