Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNA6Q15825 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNA6Q15825 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms