Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SS18Q15532 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SS18Q15532 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SS18Q15532 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SS18Q15532 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SS18Q15532 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SS18Q15532 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SS18Q15532 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SS18Q15532 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SS18Q15532 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SS18Q15532 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SS18Q15532 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SS18Q15532 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SS18Q15532 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SS18Q15532 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SS18Q15532 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SS18Q15532 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SS18Q15532 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SS18Q15532 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SS18Q15532 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SS18Q15532 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SS18Q15532 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SS18Q15532 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SS18Q15532 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SS18Q15532 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SS18Q15532 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SS18Q15532 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SS18Q15532 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SS18Q15532 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SS18Q15532 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SS18Q15532 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SS18Q15532 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SS18Q15532 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SS18Q15532 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SS18Q15532 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SS18Q15532 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SS18Q15532 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SS18Q15532 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SS18Q15532 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SS18Q15532 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SS18Q15532 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SS18Q15532 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SS18Q15532 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SS18Q15532 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SS18Q15532 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SS18Q15532 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SS18Q15532 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SS18Q15532 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SS18Q15532 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SS18Q15532 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SS18Q15532 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SS18Q15532 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SS18Q15532 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SS18Q15532 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SS18Q15532 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SS18Q15532 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SS18Q15532 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SS18Q15532 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SS18Q15532 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SS18Q15532 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SS18Q15532 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SS18Q15532 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SS18Q15532 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SS18Q15532 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SS18Q15532 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SS18Q15532 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SS18Q15532 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SS18Q15532 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SS18Q15532 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SS18Q15532 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SS18Q15532 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SS18Q15532 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SS18Q15532 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SS18Q15532 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SS18Q15532 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SS18Q15532 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SS18Q15532 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SS18Q15532 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SS18Q15532 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SS18Q15532 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SS18Q15532 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SS18Q15532 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SS18Q15532 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SS18Q15532 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SS18Q15532 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SS18Q15532 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SS18Q15532 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SS18Q15532 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SS18Q15532 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SS18Q15532 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SS18Q15532 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SS18Q15532 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SS18Q15532 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SS18Q15532 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SS18Q15532 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SS18Q15532 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SS18Q15532 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SS18Q15532 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SS18Q15532 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SS18Q15532 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms