Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTF1Q15361 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTF1Q15361 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
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