Protein–RNA interactions for Protein: Q15327

ANKRD1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD1Q15327 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD1Q15327 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD1Q15327 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD1Q15327 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD1Q15327 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD1Q15327 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD1Q15327 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD1Q15327 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD1Q15327 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD1Q15327 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD1Q15327 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD1Q15327 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD1Q15327 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD1Q15327 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD1Q15327 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD1Q15327 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD1Q15327 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD1Q15327 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD1Q15327 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD1Q15327 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD1Q15327 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD1Q15327 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD1Q15327 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD1Q15327 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD1Q15327 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD1Q15327 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD1Q15327 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD1Q15327 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms