Protein–RNA interactions for Protein: Q14677

CLINT1, Clathrin interactor 1, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLINT1Q14677 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLINT1Q14677 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLINT1Q14677 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLINT1Q14677 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLINT1Q14677 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CLINT1Q14677 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLINT1Q14677 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLINT1Q14677 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLINT1Q14677 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLINT1Q14677 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLINT1Q14677 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLINT1Q14677 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms