Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HNF4GQ14541 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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