Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM53BQ14153 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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